Гаплоидная группа

Материал из свободной русской энциклопедии «Традиция»
Перейти к: навигация, поиск
Карта расселения человека по гаплогруппам Мт-ДНК: Африка — 120000-150000 лет до н. э.
Исход из Африки — 55000-75000 лет до н. э.
Азия — 40000-70000 лет до н. э.
Австралия — 40000-60000 лет до н. э.
Европа — 35000-50000 лет до н. э.
Америки (обе) — 15000-35000 лет до н. э.
Северные/Алеуты — 8000-10000 лет до н. э.

Гапло́идная гру́ппа или сокращённо гаплогру́ппапопуляционной генетике человека, науке, изучающей генетическую историю человечества) — группа схожих гаплотипов, которые являются рядом аллелей. Термин «гаплогруппа» широко применяется в генетической генеалогии, где изучаются гаплогруппы Y-хромосомные (Y-ДНК), митохондриальные (Мт-ДНК) и ГКГ-гаплогруппы. Маркеры Y-ДНК передаются с Y-хромосомой по исключительной отцовской линии (то есть от отца сыновьям), а маркеры Мт-ДНК — по материнской линии (то есть от матери всем детям). Таким образом, мужчины являются носителями как маркеров Y-ДНК, так и маркеров Мт-ДНК, хотя и не передают последних своим потомкам.

Каждая гаплогруппа определяется суммой идентичного множества повторяемых мутаций. Это не имеет ничего общего с местом рождения, проживания или национальной принадлежности субъекта в настоящее время. При тестировании митохондриальной ДНК определяется именно количество генетических изменений. Сумма и характер мутаций помогает определить человека в ту или иную гаплогруппу. К примеру, в гаплоидную группу U5 определяют исследуемые Мт-ДНК с мутациями под номерами 16187 и 16192; наличие же дополнительных мутаций в номере 150 и отсутствие её в номере 16256 означает, что вероятно Мт-ДНК будет отнесена к подгруппе U5b.

Некоторые лаборатории анализируют части Мт-ДНК и после номера 590, фиксируя результат в своих базах данных, но многие из подобных лабораторий, которые также исследуют мутации ДНК, исследуют только HVR1 и HVR2 — не учитывая дальнейшие части по причине незначительности показаний.

Популяционная генетика гаплогрупп[править]

Гипотетическая карта миграции человека в составе определённых гаплоидных групп, составленная на основе исследований Мт-ДНК

Предположительно, естественный отбор не действует или действует очень слабо в отношении мутации, приведшей к образованию гаплогруппы и находимой в наши дни. Тогда кроме скорости мутаций, варьирующейся от маркера к маркеру, основная причина изменения соотношения гаплотипов в популяции — это генетический дрейф, случайные флуктуации, вызванные количеством потомков соответствующего пола, которым был передан данный маркер. Это приводит к постепенному изменению пропорции данного маркера либо до 100 %, либо к его полному исчезновению из популяции. В большой популяции генетический дрейф распространённых аллелей очень мал, но в малой популяции, где скрещивание проходит между близкородственными особями, пропорция аллелей изменяется относительно быстро. Таким образом, наблюдаемая географическая разница в гаплогруппах вызвана эффектом бутылочного горлышка и/или эффектом основателя, за которыми последовали разделение популяции на отдельные группы или значительное увеличение числа особей. В более недавних популяциях обнаруживаются не все аллели, которые были в предыдущей популяции: генетический дрейф приводит к исчезновению некоторых аллелей из популяции. Стоимость определения гаплотипа ограничивает количество используемых образцов, поэтому достоверность выводов ограничивается возможной статистической ошибкой.

Классификация[править]

Гаплотипами определяют индивидуальную генетическую характеристику субъекта. При рассмотрении Мт-ДНК выявляется набор персональных отклонений от «кембриджской стандартной последовательности» в сравнении с последовательностями из различных баз данных генетических исследований и устанавливается гаплогруппа той или иной персоны. Гаплогруппа — генетическая характеристика определенной общности людей, которые имели одного общего пращура по материнской линии: условно — более молодую, нежели «митохондриальная Ева». Их древние предки в основном передвигались в одной группе во время миграций по нашей древней планете. Гаплогруппа показывает, к какой генеалогической ветви человечества относится потомок. Обозначаются гаплоидные группы заглавными буквами латинского алфавита — от А до Z — с добавлением многочисленных подгрупп в виде номеров и прописных букв. К примеру, европейские гаплогруппы обозначаются буквами H, J, K, T, U, V, X. Ближневосточные — N и M. Азиатские — A, B, C, D, F, G, M, Y, Z. Африканские — L1, L2, L3 и M1. Полинезийские — B. Гаплоидные группы американских индейцев — А, B, C, D и редко Х. В последнее время к европейским гаплогруппам добавились N1, U4, U5 и W.

В настояшее время в научном мире существует чёткая номенклатура классификации гаплоидных групп.

Гаплогруппы мужской Y-ДНК[править]

Условное генеалогическое дерево, составленное по гаплоидным группам Y-хромосомы мужской части населения, выглядит следующим образом:

Данные по процентному соотношению гаплогрупп Y-хромосомы в базе данных «Mito Search» (результаты 2007 г.)

Генеалогическое дерево гаплоидных групп
мужской хромосомы человека

Y-хромосомный «Адам»
|
A BT
|
B CT
|
DE CF
| |
D E C F
|
G IJK H
|
IJ K
| |
I J LT K(xLT)
| | | |
I1 I2 J1 J2 L T M NO P S
| |
N O Q R
|
R1 R2
|
R1a R1b

В 2002 году сообщество генетиков (Y Chromosome Consortium) выработало общую классификацию и номенклатуру по линиям Y-хромосомы. Выделено 18 основных мутационных кластеров в хромосоме, так называемые клады, обозначаемые латинскими буквами от A до R. Порядок букв отражает последовательность возникновения мутаций. Эти клады в свою очередь разветвляются на гаплогруппы, которые нумеруются цифрами и буквами.

До 2002 года применялись более простые обозначения по номерам гаплогрупп: НG1, HG2 и т. д. Таблица позволяет перевести старые обозначения, используемые в научных статьях, в современную номенклатуру.

Устаревшие HG1 HG2 HG3 HG8 HG9 HG12 HG16 HG21
YCC R1b I R1a E3a J K N3 E3b

Гаплогруппы женской Мт-ДНК[править]

Данные по процентному соотношению гаплогрупп Мт-ДНК в базе данных «Mito Search» (результаты 2007 г.)

Генеалогическое дерево гаплоидных групп Мт-ДНК человека

Митохондриальная Ева
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
CZ D E G Q R A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 pre-JT P UK I N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Устаревшие кластеры IWX


Ссылки[править]

См. также[править]